Das ursprüngliche IJzendijke wurde vor über fünfhundert Jahren vom Meer verschlungen, aber dank des spanischen Herzogs von Parma erstand der Ort einige Kilometer entfernt wieder in Form eines Verteidigungsbollwerks. Im Jahr 1604 vertrieb Prinz Maurits die Spanier aus ihrem "Fort Ysendijck" und ließ sofort die Verteidigungsanlagen verstärken. Danach musste die Stadt noch verschiedene spanische, französische und deutsche Stürme überstehen. IJzendijke lag 1944 an der Frontlinie im Kampf um die Westerschelde. Auch die Belgier zeigten 1830 Interesse an IJzendijke.